| 稿件标题： | 慢性缺氧对胶质母细胞瘤 DNA 修复基因表达的 影响及生物信息学分析 |
| 稿件作者： | 李瑞静,杨威利,延兴学,李纪同,王潇娜,张耀东 |
| 关键字词： | [关键词] 慢性缺氧; 胶质母细胞瘤; DNA 修复基因表达; 信号通路; 治疗靶点 |
| 文章摘要： | [摘 要] 目的 分析慢性缺氧对胶质母细胞瘤 DNA 修复基因表达的影响,寻找胶质母细胞瘤潜在的治 疗靶点。方法 使用limmaR 包对 GEO 芯片数据(GSE139250)进行差异计算,利用 ggplot包绘制火山图, GeneOncology与 KEGG 软件对差异基因的生物过程、分子功能及信号通路进行富集分析,并进一步通过 String数据库分析差异表达基因的相互作用网络。结果 GSE139250数据库中180个基因通过差异筛选,7个 基因出现差异表达,3个基因表达升高,4个基因表达下调。分子功能富集分析显示上调的3个基因(ABL1、 DDB2和 EGFR)主要与酪氨酸激酶活性、磷酸酶结合、肌动蛋白丝结合等相关,下调的 4 个基因(PARP1、 ATR、BCL2和 LIG4)富集于细胞分化、增殖、凋亡、DNA 复制和细胞有丝分裂等;KEGG 信号通路分析显示差 异表达基因主要与 P53信号通路、志贺氏菌、胃癌、结直肠癌、癌症中 microRNA 等通路相关。结论 胶质母细 胞瘤慢性缺氧可引起酪氨酸激酶活性、蛋白质磷酸化和肌动蛋白异常,引起细胞DNA 复制等过程中DNA 损伤 及细胞增殖与凋亡等,靶向 DNA 复制及蛋白质酪氨酸激酶激活和磷酸化过程等分子信号通路可为胶质母细胞 瘤提供潜在的治疗靶点。 |
| 文章基金： | 基金项目:国家自然科学基金项目(81901387);河南省医学科技攻关联合共建项目(LHGJ20190965)。 |
| 杂志名称： | 现代医药卫生 |
| 文章刊期： | 2021年37卷17期 |
| 文章栏目： | 论著 |
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