注册 忘记密码
稿件信息
稿件标题: 人源TNF-α蛋白生物信息学分析及相关治疗思路研究
稿件作者: 蹇艾利,申元英,姜石松
关键字词: [关键词] 肿瘤坏死因子-α; 生物信息学分析; 治疗; 预测
文章摘要: [摘 要] 目的 应用生物信息学分析软件预测并分析人源肿瘤坏死因子-α(TNF-α)蛋白结构和功能,并结合该课题组前期实验结果提出一些新的治疗思路。方法 利用在线Uniprot蛋白数据库、Expasy在线预测网站、SignalP-5.0、TMHMM Server V2.0、Cell-Ploc、SOPMA、SWISS-MODEL、在线数据库Protscale等生物信息学预测软件对人源TNF-α蛋白理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、空间结构及疏水性分析;登录“http://www.cbs.dtu.dk/services/netrhos/”网站对该蛋白磷酸化位点进行预测;选取String及IEDB等在线网站分析人源TNF-α的相互作用蛋白及该蛋白优势表位预测。结果 人源TNF-α蛋白为编码233个氨基酸的蛋白质,相对分子质量为26×103,为不太稳定的亲水性蛋白,有跨膜区,无信号肽;预测该蛋白亚细胞定位在细胞膜中,蛋白序列中存在15个丝氨酸磷酸化位点,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;三级结构模型显示该蛋白可形成同源三聚体,有多种蛋白与之相互作用。结论 生物信息学预测分析人源TNF-α含有多个磷酸化位点和B细胞优势表位,并且该表位与前期实验找到的功能性肽段序列相符,可为临床针对人源TNF-α设计多肽或药物提供新靶点。
文章基金: 基金项目:国家自然科学基金项目(81641095)。
杂志名称: 现代医药卫生
文章刊期: 2022年38卷12期
文章栏目: 论著
相关信息: 文件大小:8.59 MB
页码:1981
浏览次数:1748
下载次数:30
免费查看全文 下载PDF阅读器 下载本期目录 下载本期封面